Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Irx1P81068 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx1P81068 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Irx1P81068 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Irx1P81068 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx1P81068 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Irx1P81068 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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