Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CiitaP79621 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CiitaP79621 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CiitaP79621 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CiitaP79621 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CiitaP79621 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CiitaP79621 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CiitaP79621 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CiitaP79621 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CiitaP79621 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CiitaP79621 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CiitaP79621 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CiitaP79621 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms