Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf3P70671 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf3P70671 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf3P70671 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf3P70671 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf3P70671 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf3P70671 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Irf3P70671 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf3P70671 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf3P70671 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf3P70671 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf3P70671 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf3P70671 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf3P70671 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Irf3P70671 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms