Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pitx1P70314 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pitx1P70314 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pitx1P70314 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms