Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vamp7P70280 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp7P70280 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vamp7P70280 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms