Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad54lP70270 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rad54lP70270 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad54lP70270 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms