Protein–RNA interactions for Protein: P70248

Myo1f, Unconventional myosin-If, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1fP70248 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Myo1fP70248 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myo1fP70248 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myo1fP70248 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms