Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp2P63044 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vamp2P63044 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms