Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps3P62908 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps3P62908 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps3P62908 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rps3P62908 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps3P62908 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps3P62908 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps3P62908 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps3P62908 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps3P62908 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rps3P62908 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps3P62908 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps3P62908 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rps3P62908 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms