Protein–RNA interactions for Protein: P62878

Rbx1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbx1P62878 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbx1P62878 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbx1P62878 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbx1P62878 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbx1P62878 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbx1P62878 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbx1P62878 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbx1P62878 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbx1P62878 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbx1P62878 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbx1P62878 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbx1P62878 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbx1P62878 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbx1P62878 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbx1P62878 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbx1P62878 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbx1P62878 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbx1P62878 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbx1P62878 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbx1P62878 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbx1P62878 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbx1P62878 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbx1P62878 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbx1P62878 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbx1P62878 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbx1P62878 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbx1P62878 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbx1P62878 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbx1P62878 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbx1P62878 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbx1P62878 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbx1P62878 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbx1P62878 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbx1P62878 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbx1P62878 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbx1P62878 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbx1P62878 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbx1P62878 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbx1P62878 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbx1P62878 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbx1P62878 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbx1P62878 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbx1P62878 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbx1P62878 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbx1P62878 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbx1P62878 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbx1P62878 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbx1P62878 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbx1P62878 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbx1P62878 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbx1P62878 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbx1P62878 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbx1P62878 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbx1P62878 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbx1P62878 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbx1P62878 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbx1P62878 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbx1P62878 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbx1P62878 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbx1P62878 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbx1P62878 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbx1P62878 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbx1P62878 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbx1P62878 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbx1P62878 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbx1P62878 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms