Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gnb1P62874 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gnb1P62874 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms