Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pou3f4P62515 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pou3f4P62515 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pou3f4P62515 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms