Protein–RNA interactions for Protein: P62340

Tbpl1, TATA box-binding protein-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbpl1P62340 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tbpl1P62340 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Tbpl1P62340 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tbpl1P62340 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms