Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SnrpfP62307 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SnrpfP62307 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SnrpfP62307 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms