Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Rps29P62274 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rps29P62274 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps29P62274 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rps29P62274 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps29P62274 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps29P62274 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps29P62274 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps29P62274 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps29P62274 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps29P62274 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Rps29P62274 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rps29P62274 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms