Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga11P61622 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga11P61622 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga11P61622 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga11P61622 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga11P61622 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga11P61622 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga11P61622 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga11P61622 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga11P61622 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga11P61622 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga11P61622 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms