Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abce1P61222 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abce1P61222 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abce1P61222 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abce1P61222 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abce1P61222 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Abce1P61222 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abce1P61222 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abce1P61222 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms