Protein–RNA interactions for Protein: P61211

Arl1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl1P61211 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl1P61211 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Arl1P61211 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl1P61211 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl1P61211 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl1P61211 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Arl1P61211 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Arl1P61211 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms