Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp1P60335 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcbp1P60335 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcbp1P60335 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms