Protein–RNA interactions for Protein: P59481

Lman2l, VIP36-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lman2lP59481 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lman2lP59481 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lman2lP59481 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms