Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpm2P58774 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpm2P58774 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpm2P58774 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms