Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpaP58389 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpaP58389 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpaP58389 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpaP58389 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpaP58389 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpaP58389 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PtpaP58389 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpaP58389 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpaP58389 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpaP58389 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PtpaP58389 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PtpaP58389 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PtpaP58389 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtpaP58389 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PtpaP58389 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms