Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Uchl4P58321 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms