Protein–RNA interactions for Protein: P57748

Mmp20, Matrix metalloproteinase-20, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp20P57748 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Mmp20P57748 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mmp20P57748 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mmp20P57748 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms