Protein–RNA interactions for Protein: P56959

Fus, RNA-binding protein FUS, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FusP56959 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FusP56959 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FusP56959 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FusP56959 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FusP56959 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FusP56959 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FusP56959 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FusP56959 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FusP56959 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FusP56959 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FusP56959 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FusP56959 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FusP56959 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FusP56959 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FusP56959 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FusP56959 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FusP56959 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FusP56959 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FusP56959 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FusP56959 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FusP56959 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FusP56959 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FusP56959 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FusP56959 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FusP56959 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FusP56959 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FusP56959 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FusP56959 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FusP56959 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FusP56959 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FusP56959 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FusP56959 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FusP56959 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FusP56959 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FusP56959 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FusP56959 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FusP56959 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FusP56959 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FusP56959 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FusP56959 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FusP56959 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FusP56959 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FusP56959 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FusP56959 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FusP56959 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FusP56959 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FusP56959 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FusP56959 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FusP56959 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FusP56959 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FusP56959 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FusP56959 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FusP56959 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FusP56959 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FusP56959 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FusP56959 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FusP56959 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FusP56959 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FusP56959 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FusP56959 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FusP56959 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FusP56959 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FusP56959 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FusP56959 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FusP56959 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FusP56959 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FusP56959 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FusP56959 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FusP56959 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FusP56959 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FusP56959 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FusP56959 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FusP56959 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FusP56959 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FusP56959 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FusP56959 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FusP56959 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FusP56959 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FusP56959 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FusP56959 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FusP56959 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FusP56959 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FusP56959 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FusP56959 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FusP56959 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FusP56959 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FusP56959 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FusP56959 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FusP56959 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FusP56959 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FusP56959 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FusP56959 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FusP56959 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FusP56959 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FusP56959 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FusP56959 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FusP56959 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FusP56959 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FusP56959 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FusP56959 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms