Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gsc2P56916 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gsc2P56916 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms