Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Cldn18P56857 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
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Cldn18P56857 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Cldn18P56857 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Cldn18P56857 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cldn18P56857 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Cldn18P56857 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Cldn18P56857 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Cldn18P56857 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Cldn18P56857 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn18P56857 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms