Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rp1P56716 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rp1P56716 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rp1P56716 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rp1P56716 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rp1P56716 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rp1P56716 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rp1P56716 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rp1P56716 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rp1P56716 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rp1P56716 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms