Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CdaP56389 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CdaP56389 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CdaP56389 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CdaP56389 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CdaP56389 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CdaP56389 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CdaP56389 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CdaP56389 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CdaP56389 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CdaP56389 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CdaP56389 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CdaP56389 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CdaP56389 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CdaP56389 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CdaP56389 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CdaP56389 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CdaP56389 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CdaP56389 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CdaP56389 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CdaP56389 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CdaP56389 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CdaP56389 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CdaP56389 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CdaP56389 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CdaP56389 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CdaP56389 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CdaP56389 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CdaP56389 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CdaP56389 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CdaP56389 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CdaP56389 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CdaP56389 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CdaP56389 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CdaP56389 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CdaP56389 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CdaP56389 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CdaP56389 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CdaP56389 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CdaP56389 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CdaP56389 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CdaP56389 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CdaP56389 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CdaP56389 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CdaP56389 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CdaP56389 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CdaP56389 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CdaP56389 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CdaP56389 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CdaP56389 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CdaP56389 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CdaP56389 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CdaP56389 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CdaP56389 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CdaP56389 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CdaP56389 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CdaP56389 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CdaP56389 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CdaP56389 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CdaP56389 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CdaP56389 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CdaP56389 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CdaP56389 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CdaP56389 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CdaP56389 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CdaP56389 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CdaP56389 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CdaP56389 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CdaP56389 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CdaP56389 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CdaP56389 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CdaP56389 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CdaP56389 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CdaP56389 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CdaP56389 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CdaP56389 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CdaP56389 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CdaP56389 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CdaP56389 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CdaP56389 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CdaP56389 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CdaP56389 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CdaP56389 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CdaP56389 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CdaP56389 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CdaP56389 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CdaP56389 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CdaP56389 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CdaP56389 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CdaP56389 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CdaP56389 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CdaP56389 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CdaP56389 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CdaP56389 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CdaP56389 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CdaP56389 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CdaP56389 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CdaP56389 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CdaP56389 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CdaP56389 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms