Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh3bp1P55194 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh3bp1P55194 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh3bp1P55194 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms