Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcd3P55096 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcd3P55096 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Abcd3P55096 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms