Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cacnb3P54285 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cacnb3P54285 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacnb3P54285 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms