Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XpcP51612 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XpcP51612 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XpcP51612 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XpcP51612 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XpcP51612 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XpcP51612 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XpcP51612 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
XpcP51612 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XpcP51612 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
XpcP51612 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XpcP51612 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XpcP51612 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
XpcP51612 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
XpcP51612 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XpcP51612 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XpcP51612 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XpcP51612 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XpcP51612 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XpcP51612 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XpcP51612 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XpcP51612 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
XpcP51612 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XpcP51612 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
XpcP51612 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XpcP51612 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XpcP51612 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XpcP51612 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
XpcP51612 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
XpcP51612 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XpcP51612 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XpcP51612 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XpcP51612 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
XpcP51612 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XpcP51612 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XpcP51612 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
XpcP51612 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XpcP51612 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XpcP51612 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XpcP51612 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XpcP51612 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
XpcP51612 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XpcP51612 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XpcP51612 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XpcP51612 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XpcP51612 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
XpcP51612 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XpcP51612 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
XpcP51612 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
XpcP51612 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XpcP51612 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XpcP51612 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
XpcP51612 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
XpcP51612 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
XpcP51612 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
XpcP51612 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XpcP51612 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XpcP51612 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XpcP51612 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XpcP51612 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
XpcP51612 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
XpcP51612 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XpcP51612 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XpcP51612 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
XpcP51612 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XpcP51612 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XpcP51612 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XpcP51612 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XpcP51612 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XpcP51612 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XpcP51612 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
XpcP51612 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
XpcP51612 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XpcP51612 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XpcP51612 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XpcP51612 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
XpcP51612 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
XpcP51612 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XpcP51612 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XpcP51612 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XpcP51612 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
XpcP51612 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XpcP51612 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
XpcP51612 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XpcP51612 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XpcP51612 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XpcP51612 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XpcP51612 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XpcP51612 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XpcP51612 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XpcP51612 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XpcP51612 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XpcP51612 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XpcP51612 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XpcP51612 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
XpcP51612 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
XpcP51612 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XpcP51612 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
XpcP51612 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
XpcP51612 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms