Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn1swP51491 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Opn1swP51491 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn1swP51491 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn1swP51491 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn1swP51491 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn1swP51491 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn1swP51491 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn1swP51491 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn1swP51491 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn1swP51491 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn1swP51491 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Opn1swP51491 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Opn1swP51491 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Opn1swP51491 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Opn1swP51491 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Opn1swP51491 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms