Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CastP51125 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CastP51125 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CastP51125 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CastP51125 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CastP51125 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CastP51125 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CastP51125 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CastP51125 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CastP51125 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CastP51125 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CastP51125 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CastP51125 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CastP51125 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CastP51125 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CastP51125 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CastP51125 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CastP51125 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CastP51125 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CastP51125 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CastP51125 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CastP51125 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CastP51125 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CastP51125 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CastP51125 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CastP51125 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CastP51125 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CastP51125 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CastP51125 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CastP51125 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CastP51125 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CastP51125 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CastP51125 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CastP51125 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CastP51125 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CastP51125 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CastP51125 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CastP51125 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CastP51125 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CastP51125 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CastP51125 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CastP51125 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CastP51125 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CastP51125 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CastP51125 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CastP51125 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CastP51125 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CastP51125 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CastP51125 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CastP51125 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CastP51125 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CastP51125 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CastP51125 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CastP51125 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CastP51125 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CastP51125 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CastP51125 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CastP51125 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CastP51125 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CastP51125 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CastP51125 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CastP51125 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CastP51125 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CastP51125 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CastP51125 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CastP51125 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CastP51125 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CastP51125 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CastP51125 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CastP51125 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CastP51125 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CastP51125 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CastP51125 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CastP51125 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CastP51125 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CastP51125 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CastP51125 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CastP51125 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CastP51125 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CastP51125 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CastP51125 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CastP51125 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CastP51125 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CastP51125 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CastP51125 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CastP51125 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CastP51125 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CastP51125 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CastP51125 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CastP51125 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CastP51125 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CastP51125 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CastP51125 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CastP51125 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CastP51125 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CastP51125 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CastP51125 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CastP51125 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CastP51125 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CastP51125 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms