Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FanccP50652 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FanccP50652 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FanccP50652 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FanccP50652 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FanccP50652 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FanccP50652 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FanccP50652 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FanccP50652 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FanccP50652 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FanccP50652 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FanccP50652 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FanccP50652 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FanccP50652 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FanccP50652 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FanccP50652 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FanccP50652 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FanccP50652 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FanccP50652 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FanccP50652 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FanccP50652 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FanccP50652 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FanccP50652 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FanccP50652 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FanccP50652 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FanccP50652 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FanccP50652 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FanccP50652 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FanccP50652 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FanccP50652 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FanccP50652 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FanccP50652 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FanccP50652 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FanccP50652 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FanccP50652 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FanccP50652 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FanccP50652 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FanccP50652 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FanccP50652 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FanccP50652 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FanccP50652 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FanccP50652 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FanccP50652 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FanccP50652 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FanccP50652 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FanccP50652 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FanccP50652 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FanccP50652 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FanccP50652 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FanccP50652 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FanccP50652 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FanccP50652 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FanccP50652 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FanccP50652 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FanccP50652 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FanccP50652 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FanccP50652 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FanccP50652 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FanccP50652 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FanccP50652 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FanccP50652 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FanccP50652 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FanccP50652 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FanccP50652 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FanccP50652 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FanccP50652 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FanccP50652 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FanccP50652 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FanccP50652 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FanccP50652 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FanccP50652 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FanccP50652 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FanccP50652 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FanccP50652 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FanccP50652 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FanccP50652 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FanccP50652 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FanccP50652 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FanccP50652 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FanccP50652 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FanccP50652 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FanccP50652 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FanccP50652 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FanccP50652 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FanccP50652 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FanccP50652 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FanccP50652 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FanccP50652 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FanccP50652 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FanccP50652 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FanccP50652 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FanccP50652 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FanccP50652 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FanccP50652 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FanccP50652 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FanccP50652 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FanccP50652 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FanccP50652 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FanccP50652 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FanccP50652 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.3 ms