Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BckdhaP50136 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BckdhaP50136 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BckdhaP50136 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BckdhaP50136 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BckdhaP50136 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BckdhaP50136 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BckdhaP50136 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BckdhaP50136 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BckdhaP50136 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BckdhaP50136 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BckdhaP50136 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BckdhaP50136 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BckdhaP50136 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BckdhaP50136 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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