Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTCFP49711 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTCFP49711 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CTCFP49711 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTCFP49711 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTCFP49711 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTCFP49711 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTCFP49711 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTCFP49711 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTCFP49711 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTCFP49711 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTCFP49711 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTCFP49711 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTCFP49711 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTCFP49711 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTCFP49711 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTCFP49711 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTCFP49711 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTCFP49711 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CTCFP49711 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTCFP49711 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTCFP49711 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTCFP49711 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTCFP49711 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTCFP49711 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTCFP49711 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTCFP49711 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTCFP49711 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTCFP49711 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTCFP49711 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTCFP49711 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTCFP49711 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTCFP49711 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTCFP49711 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTCFP49711 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTCFP49711 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTCFP49711 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTCFP49711 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTCFP49711 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTCFP49711 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTCFP49711 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CTCFP49711 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CTCFP49711 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTCFP49711 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTCFP49711 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTCFP49711 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CTCFP49711 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CTCFP49711 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTCFP49711 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTCFP49711 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTCFP49711 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTCFP49711 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTCFP49711 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CTCFP49711 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTCFP49711 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTCFP49711 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTCFP49711 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTCFP49711 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTCFP49711 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTCFP49711 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTCFP49711 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTCFP49711 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTCFP49711 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTCFP49711 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTCFP49711 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTCFP49711 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTCFP49711 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTCFP49711 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTCFP49711 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTCFP49711 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTCFP49711 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTCFP49711 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTCFP49711 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTCFP49711 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CTCFP49711 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CTCFP49711 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CTCFP49711 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTCFP49711 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTCFP49711 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTCFP49711 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTCFP49711 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTCFP49711 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CTCFP49711 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTCFP49711 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTCFP49711 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTCFP49711 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTCFP49711 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CTCFP49711 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTCFP49711 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTCFP49711 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTCFP49711 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTCFP49711 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTCFP49711 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTCFP49711 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTCFP49711 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTCFP49711 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTCFP49711 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTCFP49711 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTCFP49711 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CTCFP49711 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms