Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpreP49446 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpreP49446 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpreP49446 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpreP49446 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpreP49446 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpreP49446 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpreP49446 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpreP49446 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtpreP49446 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpreP49446 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PtpreP49446 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms