Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HpdP49429 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HpdP49429 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HpdP49429 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HpdP49429 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HpdP49429 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HpdP49429 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HpdP49429 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HpdP49429 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HpdP49429 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HpdP49429 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HpdP49429 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HpdP49429 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HpdP49429 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HpdP49429 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HpdP49429 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HpdP49429 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HpdP49429 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HpdP49429 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HpdP49429 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HpdP49429 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HpdP49429 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HpdP49429 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HpdP49429 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HpdP49429 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HpdP49429 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HpdP49429 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HpdP49429 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HpdP49429 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HpdP49429 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HpdP49429 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HpdP49429 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HpdP49429 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HpdP49429 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HpdP49429 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HpdP49429 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HpdP49429 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HpdP49429 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HpdP49429 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HpdP49429 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HpdP49429 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HpdP49429 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HpdP49429 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HpdP49429 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HpdP49429 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HpdP49429 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HpdP49429 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HpdP49429 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HpdP49429 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HpdP49429 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HpdP49429 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HpdP49429 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HpdP49429 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HpdP49429 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HpdP49429 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HpdP49429 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HpdP49429 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HpdP49429 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HpdP49429 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HpdP49429 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HpdP49429 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HpdP49429 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HpdP49429 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HpdP49429 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HpdP49429 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HpdP49429 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HpdP49429 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HpdP49429 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HpdP49429 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HpdP49429 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HpdP49429 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HpdP49429 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HpdP49429 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HpdP49429 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HpdP49429 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HpdP49429 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HpdP49429 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HpdP49429 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HpdP49429 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HpdP49429 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HpdP49429 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HpdP49429 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HpdP49429 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HpdP49429 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HpdP49429 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HpdP49429 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HpdP49429 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HpdP49429 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HpdP49429 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HpdP49429 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HpdP49429 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HpdP49429 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HpdP49429 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HpdP49429 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HpdP49429 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HpdP49429 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HpdP49429 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HpdP49429 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HpdP49429 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HpdP49429 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms