Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Abcd1P48410 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcd1P48410 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcd1P48410 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms