Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab11bP46638 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab11bP46638 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms