Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sipa1P46062 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sipa1P46062 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sipa1P46062 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sipa1P46062 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sipa1P46062 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sipa1P46062 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sipa1P46062 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sipa1P46062 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sipa1P46062 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sipa1P46062 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sipa1P46062 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sipa1P46062 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sipa1P46062 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sipa1P46062 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sipa1P46062 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sipa1P46062 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sipa1P46062 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sipa1P46062 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sipa1P46062 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sipa1P46062 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sipa1P46062 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sipa1P46062 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sipa1P46062 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sipa1P46062 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sipa1P46062 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sipa1P46062 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sipa1P46062 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sipa1P46062 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sipa1P46062 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sipa1P46062 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sipa1P46062 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sipa1P46062 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sipa1P46062 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sipa1P46062 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sipa1P46062 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sipa1P46062 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sipa1P46062 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sipa1P46062 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sipa1P46062 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sipa1P46062 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sipa1P46062 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sipa1P46062 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sipa1P46062 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sipa1P46062 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sipa1P46062 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sipa1P46062 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Sipa1P46062 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sipa1P46062 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms