Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gdf5P43027 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gdf5P43027 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms