Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NodalP43021 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NodalP43021 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NodalP43021 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NodalP43021 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NodalP43021 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NodalP43021 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NodalP43021 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NodalP43021 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NodalP43021 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NodalP43021 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NodalP43021 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NodalP43021 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NodalP43021 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NodalP43021 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NodalP43021 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NodalP43021 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NodalP43021 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NodalP43021 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NodalP43021 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NodalP43021 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NodalP43021 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NodalP43021 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NodalP43021 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NodalP43021 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NodalP43021 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NodalP43021 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NodalP43021 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NodalP43021 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NodalP43021 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NodalP43021 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NodalP43021 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NodalP43021 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NodalP43021 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NodalP43021 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NodalP43021 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NodalP43021 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NodalP43021 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NodalP43021 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NodalP43021 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NodalP43021 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NodalP43021 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NodalP43021 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NodalP43021 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NodalP43021 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NodalP43021 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NodalP43021 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NodalP43021 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NodalP43021 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NodalP43021 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NodalP43021 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NodalP43021 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NodalP43021 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NodalP43021 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NodalP43021 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NodalP43021 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NodalP43021 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NodalP43021 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NodalP43021 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NodalP43021 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NodalP43021 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NodalP43021 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NodalP43021 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NodalP43021 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NodalP43021 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NodalP43021 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NodalP43021 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NodalP43021 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NodalP43021 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NodalP43021 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NodalP43021 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NodalP43021 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NodalP43021 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NodalP43021 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NodalP43021 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NodalP43021 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NodalP43021 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NodalP43021 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NodalP43021 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NodalP43021 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NodalP43021 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NodalP43021 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NodalP43021 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NodalP43021 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NodalP43021 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NodalP43021 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NodalP43021 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NodalP43021 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NodalP43021 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NodalP43021 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NodalP43021 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NodalP43021 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NodalP43021 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NodalP43021 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NodalP43021 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NodalP43021 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NodalP43021 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NodalP43021 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NodalP43021 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NodalP43021 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms