Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ighmbp2P40694 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ighmbp2P40694 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms