Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VhlP40338 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VhlP40338 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
VhlP40338 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VhlP40338 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VhlP40338 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VhlP40338 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VhlP40338 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VhlP40338 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VhlP40338 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VhlP40338 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VhlP40338 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VhlP40338 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17■□□□□ 0.31
VhlP40338 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
VhlP40338 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VhlP40338 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VhlP40338 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VhlP40338 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VhlP40338 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VhlP40338 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VhlP40338 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VhlP40338 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VhlP40338 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VhlP40338 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
VhlP40338 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VhlP40338 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VhlP40338 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VhlP40338 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VhlP40338 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VhlP40338 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VhlP40338 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VhlP40338 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VhlP40338 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VhlP40338 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VhlP40338 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VhlP40338 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VhlP40338 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VhlP40338 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VhlP40338 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VhlP40338 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VhlP40338 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VhlP40338 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VhlP40338 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VhlP40338 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VhlP40338 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VhlP40338 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VhlP40338 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VhlP40338 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VhlP40338 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VhlP40338 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VhlP40338 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VhlP40338 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VhlP40338 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VhlP40338 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VhlP40338 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VhlP40338 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VhlP40338 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VhlP40338 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VhlP40338 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VhlP40338 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VhlP40338 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VhlP40338 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VhlP40338 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VhlP40338 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VhlP40338 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VhlP40338 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VhlP40338 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VhlP40338 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VhlP40338 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VhlP40338 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VhlP40338 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VhlP40338 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VhlP40338 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VhlP40338 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VhlP40338 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VhlP40338 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VhlP40338 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VhlP40338 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VhlP40338 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VhlP40338 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VhlP40338 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VhlP40338 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VhlP40338 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VhlP40338 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VhlP40338 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VhlP40338 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VhlP40338 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VhlP40338 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VhlP40338 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VhlP40338 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VhlP40338 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VhlP40338 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VhlP40338 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VhlP40338 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VhlP40338 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VhlP40338 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VhlP40338 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VhlP40338 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VhlP40338 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VhlP40338 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms