Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grik2P39087 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Grik2P39087 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik2P39087 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grik2P39087 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Grik2P39087 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Grik2P39087 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik2P39087 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik2P39087 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grik2P39087 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik2P39087 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grik2P39087 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Grik2P39087 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik2P39087 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Grik2P39087 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms