Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TtlP38585 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TtlP38585 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TtlP38585 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TtlP38585 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TtlP38585 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TtlP38585 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TtlP38585 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TtlP38585 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TtlP38585 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TtlP38585 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TtlP38585 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TtlP38585 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TtlP38585 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TtlP38585 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TtlP38585 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TtlP38585 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TtlP38585 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TtlP38585 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TtlP38585 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TtlP38585 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TtlP38585 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TtlP38585 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TtlP38585 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TtlP38585 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TtlP38585 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TtlP38585 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TtlP38585 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TtlP38585 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TtlP38585 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TtlP38585 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TtlP38585 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TtlP38585 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TtlP38585 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TtlP38585 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TtlP38585 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TtlP38585 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TtlP38585 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TtlP38585 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TtlP38585 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TtlP38585 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TtlP38585 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TtlP38585 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TtlP38585 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TtlP38585 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TtlP38585 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TtlP38585 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TtlP38585 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TtlP38585 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TtlP38585 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TtlP38585 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TtlP38585 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TtlP38585 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TtlP38585 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TtlP38585 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TtlP38585 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TtlP38585 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TtlP38585 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TtlP38585 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtlP38585 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtlP38585 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtlP38585 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TtlP38585 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtlP38585 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtlP38585 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtlP38585 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TtlP38585 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TtlP38585 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TtlP38585 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TtlP38585 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TtlP38585 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TtlP38585 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TtlP38585 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TtlP38585 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TtlP38585 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TtlP38585 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TtlP38585 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TtlP38585 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TtlP38585 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TtlP38585 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TtlP38585 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TtlP38585 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TtlP38585 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TtlP38585 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TtlP38585 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TtlP38585 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtlP38585 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtlP38585 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtlP38585 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtlP38585 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtlP38585 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtlP38585 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtlP38585 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtlP38585 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TtlP38585 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TtlP38585 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TtlP38585 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TtlP38585 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TtlP38585 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TtlP38585 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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