Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ddit3P35639 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ddit3P35639 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ddit3P35639 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms